一名網友今在PTT發文，表示自己和朋友在學習網頁編程便觀摩了五倍券官網的源代碼，孰料，卻發現源代碼里生成二維碼的部分怎麼有簡體註釋，經過他比對後發現，「跟CSDN上福州司馬懿部落客上的似曾相似，應該只是程序員參考了中國大陸部落客時忘記刪除了。」
消息曝光後讓大批網友炸鍋，對此，經濟部今晚間也出面道歉並說明，五倍券官網為關貿網路公司負責開發管理，並非唐鳳政委操作。經濟部與關貿公司都表示歉意，而目前相關引用也已經修正，未來也會要求同仁必須更加謹慎。
經濟部澄清，網站系統並未外包給中國公司，並表示，程式安全及正確性是以程式源碼本身為主，註解文字部分於程式編譯或執行時，不會被納入執行，也不影響資訊安全及程式正確性。經濟部解釋，五倍券系統的開發建置，必須快速開發、反覆修改調整，並不是程式碼複製貼上即可完成，而是由關貿工程師全力趕工建置完成。
至於公告文字一度出現「質量」一事，目前也已修改為「品質」。經濟部表示，內部將會要求更確實的審查確認機制，關貿相關工程師同仁從系統建置、運作，到目前的維運，不分平假日，包括連假也都不斷測試調整，經濟部感謝關貿同仁努力，也會持續協助把關，提供國人更好的服務，共同達到振興經濟的目標。
