根據《蘋果新聞網》報導，北市過去每期疫苗預約大概可以開出40萬劑的量能，照理來說完全可以應付這期中央配發的疫苗數量，不過因為前幾期實際的預約人數有差，加上最近流感疫苗也開打、醫護人力吃緊，因此許多醫院自動調降量能，導致這期可施打劑量從40萬下降到27萬。
北市府的幕僚也透露，由於醫院調降量能後，衛生局又未能有效協調，加上許多第一梯次沒有預約到民眾，不知道可以再預約第二梯次，急著跑到外縣市去打，才會出現這次意外。
據悉，有關此事北市衛生局幾乎沒有動作，黃世傑僅跟台大醫院溝通，其他醫療院所則由醫事科長何叔安負責，至於副市長蔡炳坤因為非醫界出身、無溝通管道，僅能就北市現有的量能去做統籌分配。
對此，北市府昨（20日）也召開檢討會議，柯文哲在會中質問黃世傑：「叫不動（院方）嗎？」黃世傑便坦言自己影響力不足，希望市長出面解決，對此副市長黃珊珊建議柯文哲親下行政命令，柯文哲則決定比照疫情初期開設病床的做法，召集各大醫院院長增開量能，並揚言「誰不配合，我就公布他（醫院）名字」。
有關柯文哲撂話「不配合就公布名稱」一事，北市府發言人陳智菡則解釋，依照柯文哲過去的經驗，只要與醫院直接溝通，確定合理量能，就可以解決問題，相信醫院都願意配合，若是衛生局碰到困難，柯文哲也願意主動出面召集各大醫學中心院長協調。
而針對柯文哲出面協調醫院量能甚至撂狠話，今（21日）衛福部長陳時中則回應，他認為每個行政首長都有自己的風格，只要事情能夠順利平和來做就好。針對先前北市的指控，陳時中則解釋，以現在北市的量能加上中央協助的45,000人，相信能夠順利度過難關，陳時中也表示，疫苗開這麼多並非為了拚涵蓋率，僅是依照疫苗進貨速度，盡快配發給需要的人打。
