總統蔡英文在港版《國安法》通過後曾明確宣示，政府會緊盯港版《國安法》的施行，必要時對國民、國家相關組織發出警訊、指引，使國人不因港版《國安法》施行受傷害。本刊掌握，國安高層不僅緊盯台蘋事件發展，並在符合相關法規下出手阻擋，防止港方勢力介入台蘋；文化部甚至發函台蘋，要求不得跨境傳輸所保有的所有個人資料，避免台蘋擁有的機密資料庫落入對岸手中，使特定人受到政治迫害。
本刊調查，安永接獲任命為清盤人之後，立即隔海發函給台蘋，要求清點並移交資產；雖然這封信只是依一般公司清算的標準流程，要求台蘋交出設備、支票存根、支票簿、公司章、固定資產登記、現金存貨等，但對台灣政府而言，不啻敲響警鐘，也進一步促成國安、兩岸、財經等相關部會坐下來認真討論此事。
政府知情人士說，一般媒體買賣，只要合乎資格，政府沒有立場介入，但清算壹傳媒追根究柢是從港版《國安法》出發，港府用政治理由沒收壹傳媒最大股東黎智英的財產，進而要對台灣的公司進行處分，這件事從根源上就存在不正義的因素，況且「這不是一家一般的公司，是一家對台灣輿論環境相當有影響的公司，政府當然必須關注」。
然而，安永不到1個月就辭任清盤人，香港法院改指派譚競正會計師事務所接手壹傳媒清盤人，新的清盤人一上任，不只出新招要求台蘋往來銀行凍結台蘋帳戶，種種端倪更讓台灣政府憂心，新的清盤人是否已與現在台蘋管理層達成默契。
過去在葉一堅擔任負責人時，台蘋力推交易，但都卡在香港母公司的政治問題，導致買家卻步；隨著香港壹傳媒董事會解散、清盤人進場，去年12月台蘋主動報導「清盤人告知買賣案正在進行」的訊息，台灣方面解讀「香港清盤人帶來新買家」，對買家身分感到不安，隨後又見到台蘋工會聲明，在合法、保障勞工權益與資安前提下，「樂見」清盤人執行清算或交易，更加深政府疑慮。
