柯文哲指出，台北市政府於去年上線疫苗系統，後來中央有自己的版本，他認為一個國家不該有2個系統，所以北市就收起來，主要用中央的。「一開始還好，用到後面就很怪，不曉得為什麼預約率越來越低」，並指中央預約系統造成很多醫院抱怨，疫情趨緩後中央才將1922系統收掉。
因應疫苗預約，近日台北市再將過去疫苗系統拿出來用，但中央突在1月7號宣布第三劑隔3個月可以接種，柯文哲解釋，北市於8日加開，並準備8萬預約量能供10日至16日接種，北市於10、11和14日進行第二波預約時，中央同時開啟1922平台，所以這週才沒有北市。
柯文哲表示，北市不是不參加，而是北市系統比中央還早開，未來也會交給中央處理，並反批「不要為了黑我們，而故意去黑我們，這實在是受不了。有時候我會罵人，因為我知道在主觀認知上，我認為應該要這樣，但你們沒有照這樣做，我發現那些名嘴在黑我們時，也不知道事實真相，就是為了黑我們而黑我們，這實在不可取。」
柯文哲也說明「疫苗通行證」相關措施，指出若中央同意能界接資料，就能推行疫苗護照，將會分為綠燈打滿兩劑超過14天、或超過3個月以上打第三劑，打滿1劑為黃燈，紅燈則是未施打疫苗，場館工作人員可以顏色直覺查驗接種紀錄。
