馮世寬在農曆春節期間住進三總，就醫後發現是心律不整導致心臟衰竭的情況，還引發了肺水腫，一度需要插管治療，4日動心臟支架手術後，副主委李文忠報平安表示，手順非常順利，住進加護病房觀察，也可以拔掉呼吸器自主呼吸，狀況良好。
在住院11天後，馮世寬今上午正式出院，氣色看起來好很多，他接受媒體訪問時也表示，狀況已經比當時他剛好醫院好多了，他自己也不知道肺積水這麼嚴重，幸好三總院長很快就決定要幫他做心導管檢查，「恢復那麼快我想都是我們三總的功勞。」
馮世寬也透露，在就醫期間行政院蘇貞昌和總統蔡英文都有致電關心，蘇揆甚至告訴他蔡總統打算來探望他，「我跟她的主任祕書說不需要，然後她非常關切，而且要我每天都把狀況跟她的祕書報告，我覺得總統對我的關切讓我感覺非常的溫暖。」
對於身體狀況出現警訊，馮世寬是否有意退休療養？他用「義不容辭」4個字回應他的態度。馮世寬表示，當時總統要他來退輔會，他義不容辭，若因身體狀況不能適應，他也會義不容辭地離任。才剛出院結束治療，馮世寬卻不打算再休息一陣子，表示下午就會開始跑公務行程，要和所有的主官見見面。
