針對相關指控，本刊致電水利署長賴建信及政風室主任饒東傑查證，饒回應表示，政風系統是一條鞭，公正客觀，並未包庇，賴也沒有指示調查方向，該處理都有處理。至於賴電話未接、留言未回，至截稿前無法得知其回應。
不過，楊的友人表示，楊偉甫沒有姊妹，親戚姓黃的只有媽媽，全世界根本沒有人叫他舅舅，如果有人打著是他外甥的名號，一定是招搖撞騙之人，而且楊自從離開經濟部之後，就再也沒有管過水利署的事。
水利署指出，本案去年經週刊報導當日，第一時間就已請人事、政風仔細調查，秉公處理。
經政風單位就週刊所報逐一獨立調查後，在公務表現上黃及許員表現良好，公領域並無不法之處，但為避免兩人私領域行為影響機關及同仁，故將兩人降調非主管職務，其中黃員並調離現職至台東。
賴建信署長則表示，其在職場上一向秉持專業認真做事，周刊報導涉及他本人的部分並非事實，經查黃員根本也非台電楊偉甫前董事長的親戚，所謂「舅舅」之說也不正確。
水利署表示，陳情人多次陳情指涉之事均依規定機制處理，呼籲不應因個別私領域糾紛，影響水利團隊士氣。
