依據《兩岸人民關係條例》，台灣人民、法人、團體或其他機構，非經各該主管機關許可，不得與中國「黨務、軍事、行政、具政治性機關 （構）、團體或涉及對台政治工作、影響國家安全或利益之機關 （構）、團體為任何形式之合作行為」。
去年台大特聘終身教授李篤中，被立委范雲等人踢爆，獲聘為中國哈爾濱大學「長江學者」講座教授，甚至名列「千人計畫」名單，長年拿對岸官方經費做研究，有違法兼職疑慮，教育部當時亦做出裁罰，認定李篤中違反《兩岸人民關係條例》，處罰新台幣30萬元。
但早在2017年，元智創校元老之一的教授張百棧，就被媒體踢爆在台灣任專任教授卻在中國兼差，除了教書還擔任教務長，領取約新台幣450萬元的年薪，1991年至2016年間，還拿了科技部4,000萬元的學術補助做研究，遭到輿論撻伐。
當時教育部聲稱，台灣的大學教授不適合在中國擔任教職，即使是兼任也不宜，最多只能做短期交流，只不過事隔多年，元智教授頻繁赴中授課的風氣卻絲毫不減，連教育部也不甩。
針對這些知名學者涉及違法兼職的問題，投訴的老師認為，這些人很可能只是冰山一角，應該還有更多人是檯面下的黑數，校方及教育部等相關單位應審慎查處，不讓有心人士鑽漏洞謀取私利，卻危害國家安全。
針對指控，元智大學表示，教育部於今年2月起陸續來函，內容為有關民眾檢舉學校教師疑似疑似違法兼職一事。為慎重起見，學校於今年4月已分別召開2次調查小組會議，調查結果說明如下：
- 對於林志民講座教授、蔡篤銘教授被指控的部分，經查2人赴陸兼職均依學術交流合作協議書及合作備忘錄進行，且林志民教授回覆並未簽約就任長江學者職務。學校已於今年6月將調查結果函覆教育部，後續將依教育部回函檢討校內教師兼職核報問題，並訂立校內相關章則。
- 至於李清庭講座教授遭指控的內容，因校方近日才收到教育部公文，目前已著手組成調查小組。
