對於外界議論紛紛的公積金，高虹安數度強調，是「幹部自掏腰包贊助公用的辦公室零用金，而非來自助理費或加班費」，另也稱這些錢主要用在待客茶水、餐費、同仁下午茶和各聯繫人之間送往迎來等，她知情但不介入，錢的花用、核決和立院公費完全無關，全由行政主管直接處理。
不過，本刊根據吹哨者提供的薪資內帳及公積金總帳2份帳冊交叉比對，發現部分助理被低薪高報的薪資差額，連同部分助理的加班費都被要求退款、上繳至高虹安辦公室的公積金，內帳中至少有23筆、合計超過60萬元的應退款金額，與公積金入帳金額完全相同。
以2020年4月薪資帳目為例，助理G向立院請領的薪資為7萬元，扣除勞健保後共入帳6萬8,010元，另有上個月的加班費2萬4,820元，但該助理的實際薪資只有6萬2千元，因不同薪資的勞健保級距不同，經內帳重新計算並扣除應繳納的勞健保費後，算出他的實應領薪資為6萬137元，把已入帳薪資6萬8,010元與實應領薪資6萬137元相減，得出該助理當月的薪資差額為7,873元，連同上個月加班費合計共3萬2,693元，全被列在應退款項目中。
本刊接著比對另一份公積金帳本發現，4月17日恰有一筆3萬2,693元的「入金」紀錄，金額與助理G在4月內帳中的應退款一毛不差；無獨有偶，助理A、C在該月的應退款金額，也與當月入帳公積金款項一模一樣。
本刊交叉比對薪資內帳與公積金2本帳冊統計，自2020年2至12月，共有4名助理、總計23筆的每月應退款金額，與公積金帳本的入帳金額完全相同，11個月合計至少60萬元。吹哨者指控，此一內帳紀錄明顯打臉高虹安所宣稱，公積金是「幹部自掏腰包贊助公用」、「非來自助理費或加班費」的說法。
