吳佩蓉表示，林明溱的碩士論文《災害管理與重建成功因素之研究-以921地震前後之集集鎮觀光發展為例》，抄襲自暨南大學公共行政與政策學系的2名碩士生，分別是2007年畢業的張秦瑞和2009年畢業的陳國興。經由她的比對，內容中的文字、圖表，連續複製貼上他人論文高達5至6頁。她質問林明溱，「這不叫抄襲，什麼叫做抄襲？」
吳佩蓉認為，這件抄襲案，國民黨主席朱立倫必須站出來主持公道，因為被抄襲者之一的陳國興，他的論文題目是《領導力與地方治理：桃園縣長朱立倫之個案研究》。翻閱通篇章節內容，其對朱主席的景仰 「有如滔滔江水，連綿不絕，又如黃河氾濫，一發而不可收拾」，足見推崇、愛戴朱立倫的用心。
吳佩蓉指出，兩相對照下，治理縣政能力普通的林明溱，竟用複製貼上別人的論文來美化他自己的施政，罪加一等。呼籲朱立倫主席要秉公處理，為受害的碩士生爭取權益，向林明溱提告求償。
吳佩蓉說，不僅現任縣長許淑華論文涉及抄襲，前縣長、立委參選人林明溱的碩論也涉及大幅抄襲，國民黨連這種事情都能傳承，真的讓人瞠目結舌！
針對指控，朝陽科大校方表示，目前尚未接獲檢舉，若收到具名檢舉，會在1個月內組成博、碩士學位論文違反學術倫理審定委員會，最快將於委員會組成後3個月內完成調查報告及做出具體決議。吳佩蓉則表示，會再了解校方對檢舉論文抄襲的相關規定，如果只需寄件，她會整理好資料後寄出，但若須本人到場，必須再思考如何進行較為妥適。
