去年6月，日舞公司原本以戲劇《紅手指》獲評審青睞，得到文化部補助2,800萬元輔導金，金額之高，歷年罕見。不過，輔導金補助名單公布不久，日舞公司不但大動作撤換製作人、導演等團隊班底，更打算大改劇本，劇情跟評審們當初看的大相逕庭。
日舞公司此舉恐有詐領輔導金之疑，文化部慎重起見，決定開會重審，評審們幾經討論後，最後以團隊企劃變更太大，顯然與當初通過補助的案子不同為由，取消補助金，文化部還特別取得全體評審的同意，向日舞公司具體敘明取消補助的理由。但政商關係良好的陳宗基對此決議不服，事後竟有多位立委出面關說施壓，企圖翻盤，讓文化部不堪其擾。
前立委邱毅曾爆料，綠營新系大老吳乃仁曾在2002年和遊戲商公司代表陳宗基同遊濟州島並至賭場，連前金管會主委龔照勝都被捲入，邱毅後來挨告獲判無罪，雖然雙方各說各話，但陳宗基離開媒體圈後即遊走政商名流之間，如今還順勢搭上生技產業成為副董，不但混得風生水起，也可見他八面玲瓏的公關功力不容小覷。
至於原本與陳宗基是生技發展夥伴的楊智惠曾任義大生物科技學系教授，並曾獲10大傑出女青年，今年6月遭調查局非法逮捕，並被上銬12小時引起執法過當爭議，加上承辦此案的調查官劉錦勳涉及性騷擾楊智惠，且與提告一方的三顧副董陳宗基往來密切而惹議。
此外，義大高層今年初頻頻與超基因洽談合作，校方也同意楊智惠持續借調，但到了5月間，義大高層卻告知「後面有大條的事要發生」，並決定解聘楊智惠，而楊在6月初即遭搜索約談。
楊智惠原本打算主動辭任，義大卻要求回溯至去年9月，但楊在期間擁有與杜元坤院長合作計畫案的使用權，加上楊借調期間協助義守大學取得不少專利、發表論文，並替學校取得超過3,400萬元的研究經費，外界因而質疑楊遭打壓，背後有影武者。
