全案起因是工業局要求三顧補件，陳宗基透過楊智惠希望爭取杜元坤授權提供資料，因為楊與杜是研究計畫的共同成員，應該可以成事，但杜卻非常不悅地去函楊智惠，盼她以董事長身分查明此事，甚至以牛頭不對馬嘴及張冠李戴等強烈字眼來痛罵陳宗基企圖盜用他的研究成果。
根據杜元坤的信件指出，義大醫院和三顧公司合作的膝蓋軟骨層片治療屬《特管法》，完成病例追蹤有顯著進展，但三顧向經濟部申請補助，提到的「膝軟骨細胞治療技術銜接細胞治療製劑開發計劃」臨床資料。
實際上這些都是義大醫院的研究資料，相關臨床紀錄屬於病歷之一，數據是每位病人自費80萬元買產品治療而來，這些人體試驗同意書必須繳回衛福部或用在國際醫學期刊發表，根本不能申請補助，尤其三顧在沒有委託義大醫院進行臨床試驗下，陳宗基就盜用杜元坤的醫療成果，顯然無視人體試驗及醫療法規。
因相關資料有造假之嫌，加上涉及偽造文書或詐取公款，杜元坤要求楊智惠詳查，直到事情鬧大，陳宗基才急忙想見杜元坤解釋，除了找楊智惠幫忙時說：「杜院長不高興，我也不高興。」甚至還請前中鋼董事長林文淵協助居間聯繫。
此外，陳宗基曾以董事身分主持三顧轉投資的樂迦竹北工廠發包會議，美其名是為了確保尋找承包商的公平性，但詭異的是，該場會議不見董事長或總經理參加，包括優先聘用哪位建築師進行營造廠發包及後續工地監造的關鍵決策，都在該場會議決定。
詭異的是，其中一名與會的特助，其父親是建商，會議偏偏獨漏大股東中鋼或日立公司，不免啟人疑竇。尤其樂迦甫成立之初，陳宗基一度打算找中研院前院長翁啟惠擔任董事長，近日翁被問及此事說：「這是有人刻意利用我炒作股票。」
