由於當年專偷銀行金庫的犯罪集團，全台至少5個，斷點做得很好，讓警方十分頭痛，專案小組仔細過濾每1件穿牆竊案，結果發現聯邦銀行東台北分行的保險庫竊案，手法跟這次華南銀行大稻埕分行金庫竊案非常相似，但2案都沒有積極證據，一直陷於膠著，連檢察官都認為這2案是「超完美竊案」。
沒想到1個多月後，1995年1月15日晚間8點多，台北市警局保安大隊4名員警正在松山火車站前地下道盤查可疑人士，1名身材瘦小的男子從地下道走上來，1名員警跟他對到眼，發現他神情有異，便將他攔下，要求出示身分證件，男子推稱沒帶，警方查看其背包，結果發現5張提款卡、8萬元千元大鈔，最後透過提款卡卡號，查出他叫林進發，是1名慣竊，還是通緝犯。
確認身分後，員警把林進發帶回警局偵訊，1名員警發揮辦案技巧，煞有其事地告訴他：「你犯的案子我們已經知道了，乾脆一點，自己交代清楚！」沒想到林沉思幾秒之後，開口就說：「華南銀行金庫竊案跟聯邦銀行保險庫竊案都是我幹的！」在場員警一聽全傻了，而轟動全台的穿牆大盜就這樣意外落網。
林進發到案之後，警方專案小組接手偵辦，他告訴警方，2起竊案都是他1人所為，華南銀行竊案部分，已經將部分贓款存入5家銀行，每家銀行存30多萬元，又拿部分贓款添購家電、洋酒，另有300多萬元放在帆布袋，因為塞不進紙箱，所以留在銀行隔壁工地3樓的空房，剩下的贓款都放在租屋處。
專案小組押解林進發回到租屋處，果然在桌子下找到大批贓款，甚至連鈔票上的封條都未拆封，金額約1,700萬元。林說，他平時跟這些錢睡在一起，每次拿一疊出來花，警方隨後也根據林的供詞，在銀行隔壁工地3樓的空房，找到了300多萬元。
對於林進發的供詞，專案小組並未全然相信，除了還有7,000萬元下落不明，他1個人獨力犯案，更是天方夜譚。
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