後來她得知，《藍眼武士》是一部成人冒險動畫影集，想到類似的工作機會或許此生難再有，幾經考慮後接下此案，身兼總導演、製片和分鏡師。為了定調風格並維持一致性，吳怡君親自執導頭尾兩集，並說服老公加入導演群。
亞倫泰勒坦言對動畫片沒興趣，認為動畫製作過程比較機械化，與執導真人演出大相逕庭，「不像導戲，反像在進行一項工程。」吳怡君希望借重他的專長，透過動畫展現真人的情感，某程度也是一種實驗，看兩者結合後呈現的結果為何。
她對亞倫泰勒的表現很滿意，因為他有些鏡頭選擇的方式很有趣，動畫圈的人做不出來，是成就《藍眼武士》如此獨特的原因之一。此劇也獲頒第76屆黃金時段艾美獎最佳動畫影集及3個技術獎項，目前正在製作第2季，吳怡君則升格擔任監製。
對此她表示，做為監製，好處是可以多雇用一些人來協助她。吳怡君解釋：「製作第一季時，我們不清楚這齣劇會發展到什麼程度，現在我們認知到它的規模很大，因此需要更多人力和時間去製作。雖然我的職銜不一樣了，不過實際工作內容大同小異 。」她也透露有可能親自執導第2季的1或2集，她的導演夫婿亞倫泰勒亦確定會執導其中一集。
