柯文哲過去帶過的學生許富舜最近在陳佩琪的臉書貼文下方留言表示，2014年他幫柯協助建置線上政治獻金的電子金流系統，當時真心相信柯能成為政治清廉典範、拒絕來路不明的金前，「然而，事實卻是，在那年，我親眼見到這些金額被帶回家。」此一留言引發熱議後卻從陳佩琪的臉書頁面上消失，但已在其他地方被備份下來。
而柯文哲初次競選台北市長時的募款委員會執行長鄭淑心也透露，當年很多媒體人幫柯辦募款餐會，現場的收到的現金都是直接給柯帶回去，就她的了解，拿回去的錢都是直接交給陳佩琪。鄭淑心後來她再遇到那些媒體人才知道，原來這些人當時都沒有收到收據，而很多直接拿到柯家的錢，後來也沒有再進到競辦的帳。
對於相關爆料，陳佩琪今（6日）上午反擊表示，「有關昨天許富舜先生和鄭淑心女士汙衊本人2014年收受政治獻金未申報一事， 本人已委由律師發出存證信函，24小時後提告刑事之加重毀謗罪（註：應為「誹謗」）和民事求償。」
此外，許富舜接受媒體訪問此事時還說，網紅醫師史書華也不滿當年捐給柯文哲的10萬元「不見了」；《自由時報》報導，史書華受訪時表示沒有收到該筆捐款的收據，監察院也沒有申報。
但陳佩琪也澄清，史書華捐的10萬元「確有其事」，日期是2014年5月20日，而會計在5月28日寄出收據，並在5月30日去電詢問是否收到，「收據編號：10330161800002800000」。
