馬英九指控，周玉蔻在2014年12月間，先後在個人臉書、《美麗島電子報》及電視談話節目，要他說明是否收受頂新2億獻金，並指他透過胡定吾收頂新2億，還說有國安高層向她證實馬英九收頂新獻金，馬自訴周誹謗後，一審台北地院認為，周發言前，曾向國安會前副秘書長張榮豐查證，且相關言論具高度公益性，因此判她無罪；胡定吾另向檢察官控告周誹謗，周另案遭起訴。
馬英九不滿判決，上訴高等法院，高院認為馬與胡提告的兩案為同一事實，因此合併審理，馬在卸任總統後，曾親自出庭，強調自己清廉自持，從不收受任何非法錢財，馬英九還當庭指周玉蔻利用污衊他所造成的新聞轟動，幾乎上遍台灣所有電視政論節目，賺進了百萬元通告費，一年內就污衊他130次，「這不是惡意、什麼是惡意」等語；胡定吾也曾出庭指周玉蔻並未向他查證。
周玉蔻則反批馬沒有格調，周玉蔻曾當庭強調，2013年馬王政爭時，她在媒體發言評論支持馬英九的做法，馬曾致電稱讚她是「空谷足音」(靜默山谷裡聽到腳步聲)、「媒體良心」，周玉蔻說，她評論馬收頂新2億元，也是「空谷足音」，她已有向相關人查證後才評論，強調自己是做一個媒體人該做的事。
高院則認為，周玉蔻為媒體工作40年，應知發言前要盡力查證，她雖曾與張榮豐及名嘴胡忠信、蔡玉貞等人討論及採訪馬英九獻金案，但周玉蔻卻過度信賴自己的判斷，沒得到客觀上可以確信的證據，就指馬英九透過胡定吾收獻金，這是陳述事實並非評論，且未經合理查證，因此判她有罪。周玉蔻則在臉書發文自稱是被「司法政治獵殺的女巫」，將要聲請大法官解釋平反。
