共13集的《麻醉2》故事緊湊，每集皆安排1場開刀戲，每2集穿插大場面意外事件，其中爆炸場面就多達5場。飾演記者的孟耿如雖不用苦背醫療術語，卻要負責動作戲，讓她忍不住自嘲：「我的角色像柯南，走到哪，哪裡就出事。」問她之後還想挑戰哪種角色？孟耿如睜著大眼想了想：「我還滿喜歡血腥的東西，應該找我開刀才對！」
《麻醉2》為台灣職人劇開闢新的合作模式，打破以往電視台僅提供固定製作費，卻擁有版權，再自行賣片獲利的方式，改由播出平台之一的「公視」、製作方「瀚草」合製、共擁版權，再結合8家公司投資，將製作費拉高到單集500萬元、13集共6,500萬元的規模，之後再以投資的百分比分潤。
導演蕭力修此次也擔任創作監製，他直言考量到海外市場的需求，所以拉長集數，內容及演員角色也就因此更豐富。除延用許瑋甯、黃健瑋、吳慷仁，第2季加入孟耿如、李國毅，深入探討不同職業跟位置的立場，觀眾也可用各種角度看故事。
雖然《麻醉2》的經費比第一季1,140萬元高出5倍之多，拍攝過程卻加倍艱難：僅是故事開發加前置期就10個月，開拍到殺青約4個月，後製特效又花了半年，光是集中在5個月內，完成包含醫療、推理元素的13集劇本，已筋疲力竭。蕭力修透露：「後來把顧問、導演組、演員集合起來，一起討論編寫劇本，再從大量資訊中，挑出符合劇情需求的內容。作法很畸形，但至少能完成任務。」
洪伯豪說：「因為時間壓縮，就得用雙倍人力工作，資源看似增加，其實被稀釋。如果有更長的前置時間、固定的醫療顧問，拍攝難度高的醫療手術戲時，就能事前模擬，不用浪費時間在現場危機處理。」
劇組雖然有合作的醫療顧問，但實際拍攝時，常出現早上設定好場景、設備及走完流程，下午準備開拍時換了醫師顧問，突然有不同見解，戲組又得重新安排。且手術戲經常得一氣呵成，工作時間少說一整天，不僅耗時費力，對於要記住大量醫療術語的演員，壓力更大。
影視作品面臨全球化的挑戰，2位導演都強調，影片若要再精緻化，就必須花更多時間準備，「《麻醉》這種有大量專業技術的戲劇，前置期至少要1年，劇本沒等完整產出就開拍，拍攝期就會不精準，如果都用一般偶像劇3個月拍20集的概念規畫，永遠拍不出好看的職人劇。」
《麻醉2》編劇群共7人，並非初期就有的編制，而是慢慢建立起來，顯見台灣好的編劇人才欠缺。另一方面，基礎拍攝工作人員也嚴重斷層，台灣影視產製，長期沒有完整制度，為節省成本壓縮工作人員權益，影響人才培養。
從副導轉任導演的洪伯豪感觸就很深：「找到一個聰明又仔細的場記，但只給2、3萬元的月薪，每天工時還超過16小時，就算他願意，家人也不見得支持。」
也許是拍攝探討公民正義的題材，導演也同樣意識到《麻醉2》工作人員的權益，「開發端規劃拍片進度，應該考慮工時，一天排12小時的量」，建立良善的工作環境留住人才，讓產業續留台灣。