「孫中山紀念圖書館文教基金會」於1994年成立，前身是國民黨文工會時代的「大時代文教基金會」，最早由前立委鄭逢時捐助成立，登記財產總額為新台幣1000萬元，其以「紀念國父孫中山先生、宏揚中山先生行誼，並以其精神為根本，關心公共政策及民意趨向，以求服務民眾、回饋社會、貢獻國家」為宗旨。
該基金會可運用資金約3000多萬元，每年孳息50萬元，若文傳會支付黨工加班費、獎金、紀念孫中山相關活動等經費不足，可由該基金會協助報帳、支出，算是文傳會的小金庫，所以歷屆董事長都是由文傳會主委兼任。
前文傳會主委周志偉去職後，改由負責督導文傳會業務的蔡正元接任，副董事長則是邱毅，董事包括李俊敏、孫揚名、毛嘉慶、周柏吟等洪系人馬，今年4月更將基金會地址從原本的國民黨八德大樓，變更到邱毅在北市興隆路的住家隔壁，未來黨中央能否拿回主導權？仍有待觀察。
知情人士說，吳敦義就任黨主席後，對是否能接收這些基金會，正陷入父子騎驢的困境，如果強要接管，怕會被黨產會認定是黨產而遭沒收，若不納入黨中央管轄，又怕被洪系人馬切割出去，永遠無法回到國民黨的體系。
