賴清德表示，行政部門會針對這事件檢討改進，避免悲劇再次發生是努力的目標。許智傑也要求針對過去普悠瑪列車採購招標傳出的更改規格等事件進行調查，賴允諾會請交通部查明。
賴清德會前受訪時表示，國人預期鐵路應該是最安全的運輸工具，沒想到卻發生意外、造成重大傷亡，因此他昨在臉書代表行政院向國人道歉。他指出，行政院組成調查小組由政務委員吳澤成主持，也有外部委員，初步調查結果和法務部一樣，都指向是彎道超速造成。
至於後續鐵路復原進度，賴清德說，要讓檢調有充分時間保全證據，做後續司法調查工作，檢調完成後會交給鐵路局做鐵道修復。交通部、台鐵局會儘速將鐵道修復完成，3天內雙線、雙向通車，恢復東部旅運的工作
另外，針對美國軍艦通過台灣海峽一事，賴清德表示，台灣尊重美國在國際海域通行的權利，也肯定美國在亞太區域和平所做的各種努力，但這是美國常規演訓，「其實每年都有，2015年就有10次之多。」
被問到中國資介入台灣選舉的議題，賴清德坦言：「這是事實。」他說，美國副總統彭斯日前演講也特別提及中國運用各種手段要影響美國選舉、內政，「對台灣當然不會放過啊！」
賴清德說，目前司法單位掌握許多確實的線索，中國運用各種管道介入這場選舉，希望每個候選人要自我約束，避免挾他國力量來進行選舉，「這是違法的」，也希望國人看清楚、拒絕這樣的事情，讓台灣選舉清清白白、乾乾淨淨、自主獨立地進行。
