台北地檢署查出，孫道存在太電案掏空等案遭查辦時，因相關資金遭凍結，他涉嫌從2012年到2018年間，挪用太平洋網球發展、孫法民文教基金會共計1.24億元公款，把基金會當私人金庫。
檢察官查出，孫道存每次都以10萬元到100萬元不等，小額從基金會搬錢，且為了應付主管機關年終審查，會回補部分款項，但他以這種循環手法，前後共侵占約1.24億元，孫道存已向檢察官坦承有這樣做，但金額沒那麼多，2019年9月間他遭依公益侵占等罪嫌起訴，當時孫道存已因太電案入獄服刑中。
孫道存在太電案服刑時，因表現不差，後來至桃園外役監執行，除了可以縮短刑期，還可以放假回家，但法務部一直不准他假釋，於2020年1月1日執行期滿，當天立即遭羈押，孫道存坦承挪用基金會款項，但金額沒那麼多，女兒會幫忙還錢，且他外役監執行期間，共有19次放假返家探親，均有提前返回監所報到，不會逃亡，不應遭羈押，他抗告後，今獲准3,000萬交保。
