為保護滯留武漢的台灣民眾免於武漢肺炎的威脅，兩岸達成協議，由中國東方航空以春節包機模式，將滯留當地的503名台灣人送回台灣，而其中必須先讓老弱傷殘、無法長期停留的民眾為優先。然而首班飛機送回來的247人，卻有許多未符合優先條件的人員，引發外界熱議，質疑徐正文將防疫資源當成自己的人情資本，讓10多名陸配先送回台灣。另外，徐正文也對無法搭上首班專機的血友病患表示會有第2班專機，但實際上第2班專機尚未談妥，他所放出的消息隨即遭陸委會駁斥。
徐正文被起底身分特殊，不僅身為中國國民黨第20屆中央委員、黃復興黨部顧問，台商黨代表，同時也是北京市特邀政協委員，讓許多民眾不滿痛批他介入登機名單是為了政治操作。而各界砲火也燒到國民黨。原先出來邀功，首班專機成行是因為黨內的「7人小組」大力協調，豈料風向丕變，國民黨在昨（5）日下午緊急發布聲明表示，徐正文的爭議行徑皆為他的個人行為，與國民黨無關。還強調，不分朝野，防疫至上，呼籲所有黨員不要有任何干涉防疫的行為或言論，否則將祭出黨紀處分。
今（6）日徐正文再提出的撤僑建議名單人數暴增，卻不含陸委會所列血友病童，徐正文僅表示，該病童並不在後援會中，不清楚他的情況，再度引發爭議。
據傳國民黨為了進一步滅火，今早就指示中央考紀會與其隸屬的黃復興黨部展開違紀調查。國民黨考紀委員魏平政指出，防疫視同作戰，徐正文之言行已經影響了防疫工作。在目前16名考紀委員中有11名委員同意下，決定先對徐正文停止黨權。未來黃復興黨部 會安排後續審議，也可能會要徐正文到親自說明，黃復興黨部若要做出停權、撤銷，或開除黨籍的處分，徐正文也能有申訴機會。
國民黨文傳會代理主委王育敏也表示，徐正文的行為已涉嫌違反疾病防制法，多次逕自公開資訊，還發布5日會有第2班包機的假訊息，造成民眾恐慌和焦慮，嚴重破壞國民黨形象聲譽，因此以最快的速度處理。
國民黨也在臉書po文，強調7人小組僅協助成立兩岸溝通渠道，並未干涉包機乘客的名單。徐正文雖為黨員，但應為個人言行負責。根據日前引發的爭議，經考紀會調查後，確定予以先行停權處分。
