為了因應五一連假出遊潮，恐導致武漢肺炎（亦稱新冠肺炎，COVID-19）疫情擴散，中央匡列出234個人潮聚集熱點，其中台南就占了27處為全國最多，這也引起黃偉哲的不滿，直言台北卻只有4處，不明警示的標準何在。
黃偉哲今日再槓上中央，點名升級版的「1968」App很有問題，他指出昨（27日）深夜約凌晨1時請同仁上App查詢，卻發現包含三峽文化商圈、鶯歌南雅路夜市、桃園大湳公有零售市場及新竹市立動物園等地都顯示「人潮略多」，讓他忍不住直疑大半夜怎麼可能出現人潮略多，「動物園半夜人多，是阿飄多嗎？還是動物多？」
就連昨日未營業的台南市同安夜市及復華夜市也顯示人潮略多，因此黃偉哲舉出台南景點一月人潮僅3、5萬人，最多不會超過8萬，卻被列入警示，若依此標準，那單月百萬人次的台北捷運每站都要列為警示，「軟體明顯對台南不公且有瑕疵，景點選擇也不客觀。」
黃偉哲表示，景點部分仍可討論，但地希望避免因為這個軟體被標籤化或汙名化，盼中央一定要檢討改進。事實上，不只台南出線App系統失準情形，陽明山竹子湖於昨日下午也出現紅燈警示，但當地里長卻指出，人潮稀落且亮紅燈的當下僅不到20人。
針對黃偉哲的砲轟，交通部長林佳龍稍早於臉書回應，直言「我是台南女婿，對台南只有鄉愁。」強調並未針對台南，而疫情指揮中心與交通部委託中華電信根據過去熱門景點資料，在1968App新增景點人潮示警，目的是希望公開資訊，能夠讓民眾理解警示與因應。
林佳龍表示，在考量揭露人數、同時保障隱私的前提下指揮中心決定採用中華電信基地台推論各景點的人潮，台南各地景點一直都深受國人喜愛，也是熱點較多的原因之一。App上線後，交通部也有發現不合理的警示，交通部樂意擔任指揮中心與各界的橋樑，找出原因，讓App的服務更符合民眾需求。
