日本政府為防止武漢肺炎（亦稱新冠肺炎，COVID-19）疫情擴大，擬全面暫停外籍人士新申請入境，這樣的話我國是否會封鎖日本經濟泡泡？莊人祥回應，經濟泡泡是以前有短期商務的做法，但當時日本為低風險或中低風險國家才可縮短檢疫時間。莊人祥表示，由於後來日本疫情愈發嚴峻，早已移出中低風險國家，因此無商業泡泡一事。
由於防疫措施升級，指揮中心宣布居家檢疫措施15日起採一人一戶，但如今防疫旅館已爆滿，讓有返國意願者的人因訂不到防疫旅館而無法買機票返國。莊人祥表示，因應新政策有函請各縣市了解房間量及訂房率，在積極請各縣市積極要求業者加入防疫旅館，預計明（6日）會有更詳細情況，再對外說明。
媒體詢問華航一名機師違反防疫規定，於居家檢疫跑去打高爾夫球與自主健康管理到商場逛街。對此，疾管署防疫醫師林詠青回應，由於事發在去年，會由航空公司做內部懲處，今年1月1日新版的機組人員管理措施無法溯及既往，該案會由華航內部進行調查，會尊重華航的懲處機制。
至於公衛部分，林詠青指出，機組員一旦違反當時提出的專案計畫，就會回到一般民眾執行居家檢疫14天，若期間違反規定就會依《傳染病防治法》做裁處，但因為案例發生在去年，所以由航空公司內部做懲處。媒體追問指揮中心是否會公布該機師的足跡？對此，莊人祥強調交由航空公司調查，「我無法調查、對這個也沒有興趣啦」。
媒體詢問有關五月天取消部分場次演唱會，外界猜測可能與先前陸續抓到有自主健康管理者亂入有關，對此指揮中心是否了解？莊人祥回應不清楚，但話鋒一轉笑稱「我有去喔，辦的很好，大家全程都有戴口罩」被追問哪一場，他則酷酷的回說：「過去式了」
