交通部稍早宣布，台鐵（五堵、汐止、汐科、南港、松山、台北、萬華、板橋、浮洲、樹林、南樹林、山佳、鶯歌；四腳亭、瑞芳、猴硐、三貂嶺、牡丹、雙溪、貢寮、福隆；平溪支線各站，及海科館線各站）、高鐵（南港、台北、板橋）以及國道客運（南港轉運站、台北轉運站、市府轉運站及板橋轉運站）及松山機場防疫措施升級。
交通部指出，上述各車站付費候車區及松山機場航空站內候機室禁止飲食；場站內餐飲區應採實聯制，鼓勵外帶，且各站每小時清潔消毒1次，每天收班後進行深度清潔消毒。
此外，為配合彈性上班，雙北台鐵區間車及捷運進行人流管制，分散尖峰人流（配合異地或遠距辦公，彈性時間）。目前東北角及北觀風景區於雙北區域內遊客服務空間關閉、雙北觀光遊樂園（雲仙樂園及野柳海洋世界）關閉。
交通部也提醒，在雙北營運之計程車應落實全程戴口罩及禁止飲食，每趟載客完畢應立即清潔消毒1次，每日收班進行深度清潔消毒。
交通部表示，針對大眾運具及場域於5月11日至6月8日期間，實施第2級防疫措施，包括禁止飲食、高鐵與台鐵城際列車全車對號座取消站票，並針對觀光遊樂景點及大型群聚活動進行管制等；另針對雙北警戒標準提升至第3級，於5月15日至5月28日期間增加採行上述雙北強化防疫措施，並呼籲第一線工作（含清潔）人員，除應加強環境徹底清潔消毒，也務必提高自身防疫安全意識。
