雖然2.5萬筆學生學習歷程檔案因人為失誤而遺失，不過教育部仍強調，111學年度起大學申請入學參採學生備審資料的制度未改變，學習歷程檔案仍是作為學生準備申請入學備審資料來源之一，「大學透過重視學習歷程，參考學生高中階段修習特定領域或科目之必修或選修課程表現，藉由檢視多種類資料，激勵學生適性發展，落實高中領域學習的完整性。」
大學招聯會也明定，各校系學習歷程檔案占分至少20％，得以讓大學校系依其專業領域選才需求，透過學生備審資料，看見學生的特質與能力。不過，醫學系、牙醫系、術科校系等不同專業領域的選才特性，備審資料占分比則另有規範。
教育部也強調，若有個別大學或個別校系參加申請入學，但認為備審資料不重要，教育部會評估並調減該校系申請入學招生名額比率，目的是以維護申請入學精神，而教育部為強化審查備審資料能夠更具專業及公平性，也會協助大學建立更系統化的審查機制、友善有效率的審查介面，以協助審查者在有限時間內進行高品質審查。
