Omicron變種病毒持續肆虐全球，台灣近日也開始出現本土確診個案，讓不少民眾擔心會再度回到去年5月時的狀況。沈政男今於臉書po文表示，台灣國門在病毒反覆敲擊下，也出現了檢疫旅館旅客與機場清潔工群聚感染。「檢疫旅館與機場是防疫前線，如今已被攻破，接下來務必守住社區防線與醫院防線」。
至於檢疫旅館與機場等首道防線為何迅速遭到攻破，沈政男分析列出4點原因，一、Omicron潛伏期平均只有3天，可在更短時間內複製更多病毒；二、大量病毒附著在環境或人員口罩與手套上，若不小心碰觸又再接觸口鼻，便容易感染；三、輕症與無症狀多，容易被當成一般感冒或根本沒發現被感染；四、因為病毒S蛋白有30多處突變，使得現有疫苗容易失效，造成大量突破性感染。
雖然台灣的首道防線遭攻破，沈政男仍強調，這樣的狀況在國外比比皆是，台灣相對上已做得比較好，「因此無須苛責相關染疫人員，而是必須用醫療機構的標準來檢視這些單位的防疫SOP，並給予人員充分訓練」。
沈政男補充提到，依照目前染疫清潔工的Ct值研判，該病毒應已複製傳播2到3輪，若在清潔工之外，目前沒有其他接觸者確診，就代表社區防線仍有一定強度；反之，如果未來1、2週出現新增案例，顯然意味社區防線也被攻破了。他也提到，若未來不能圍堵病毒，應考慮限縮群聚與內用。
從去年疫情爆發開始，國內就出現不少「不可能清零，應與病毒共存」等聲音，沈政男表示，事實證明台灣接連把舊株、Alpha變種與Delta變種都清除了。「因此接下來的防疫最高指導原則仍是『清零』2字，切莫輕易放棄，採取什麼『佛系防疫』」。
最後，沈政男不忘提醒大家，施打第3劑疫苗是追加防疫的保險，現在防疫前線已被攻破，大家應盡快施打，他更藉此呼籲中央，將第3劑間隔縮短到3個月，並考慮從把mRNA疫苗從半劑提升到全劑，以取得最佳保護力。
