辜仲諒因涉及二次金改時，他擔任中信金副董事長兼中信銀董事長，推動中信金轉投資兆豐金，有意拿下兆豐金，先以中信銀收購兆豐金買進5%持股，又利用中信銀收購轉投資兆豐金持股的結構債避險，等同額外持股兆豐金約4%。
檢方認為，辜仲諒顧慮金管會得知超額持股會使轉投資案破局，因此設立空頭公司紅火，把結構債轉賣紅火，打算等兆豐金股價因中信金獲准投資的利多消息上漲時，再由紅火贖回結構債獲取超過10億元價差，因此以違反《銀行法》、《證交法》背信罪、間接操縱股價罪起訴辜仲諒等人。
辜仲諒強調沒做對不起中信金的事，法院一、二審判刑辜仲諒9年、9年8月，更一審才認定，辜仲諒僅背信，改判3年半，更二審時認為，紅火贖回結構債獲利不等於中信金損失，若紅火沒贖回結構債，根本沒獲利，辜仲諒沒操縱股價，去年因此改判無罪。
辜仲諒也因紅火案，丟掉中信金副董、中信銀董座位置，還曾在日本滯留2年才回台。
