針對鄭文燦的案情，賴清德總統第一時間表示：「不分黨派，不問何人，只要涉及非法，檢調都應該查辦，勿枉勿縱。」賴總統的發言中規中矩，卻引來各方揣測。特別是在野黨開始腦補，一時之間陰謀論四起，他們忙著定調—這是民進黨的內鬥。鄭文燦一度是閣揆熱門人選，同時也是前總統蔡英文的愛將，賴清德為了他4年後的連任，開始整肅黨內異己、痛下殺手，除之而後快。
針對這樣子的整肅異己說，我們必須提醒讀者們注意，這是完全沒有根據的無稽之談。賴清德才上任1個多月，民進黨的民調也沒有高到哪裡去，這種時候又怎麼會親手讓自己的政黨陷入貪腐的情境中呢？鄭文燦如果真的貪汙被法院定罪，對民進黨政府又有什麼好處呢？所以，整肅異己的可能性極低，事情應該要往不同的方向來解讀。
為什麼大家會把矛頭指向賴清德？為什麼整肅異己的說法會有人相信？為什麼堂堂一個總統，在部分台灣人民心中的形象，是那種為了自身權位而不惜對同志痛下殺手的人？這些才是賴清德該認真思考的問題。換句話說，賴總統應該從整肅異己說的流行中得到一個警訊，這充分顯示他凶狠好鬥的個性，已經深深烙在台灣人民心中。他可能要問問自己，這是他要的嗎？他真的希望自己是一個鬥雞似的總統嗎？這樣子的形象，跟他時常掛在嘴邊的團結台灣是相容的嗎？
另一個賴清德必須思考的問題，是民進黨的整體形象。不管鄭文燦的官司最後結果如何，以台灣社會信者恆信、不信者恆不信的慣性，民進黨陷入貪汙疑雲的風暴可能已經開始了，至少，我們可以很確定地說，在野黨絕對會往這個方向操作。賴總統的難題在於，如何在撇清整肅異己的前提下修復民進黨的清廉形象。他的時間並不多，根據以往經驗，這種貪腐的標籤一旦被貼上之後，任何政黨都很難在短時間內撕掉。
國會沒過半、在野黨搞國會擴權、釋憲案正在進行、地方上的罷免案蠢蠢欲動，現在又增加了一個鄭文燦的難題。政局很動盪，賴總統有得忙了。
