洪申翰提到，長期以來公部門存在陋習，就是加班時數不滿一小時的時間，不予紀錄在出勤資料中，甚至有很多單位依然使用「紙本打卡」，導致多達81個需要輪班工作的警消醫護機關，無法請領應有的加班費和補休。舉例來說，如果加班1小時又55分鐘，就會有55分鐘不予紀錄。
洪申翰說，經過今年六、七月陸續召開協調會，警政署表示，有關內勤人員，中央警察機關均已完成差勤管理資訊化，且均已實施業務加班餘數併計。至於各縣市政府主管的警察機關，經過警政署於今年7月9日函請各地方警察局加強與所屬地方政府溝通協調，基隆市、苗栗縣、彰化縣、南投縣、雲林縣及嘉義縣警察局陸續函覆同意實施。
此外，有關負責值班、守望、巡邏、臨檢、勤查、備勤、警備、警衛、拘提、扣押、逮捕、犯罪偵查等警察「外勤人員」方面，根據警政署資料顯示，目前各警察機關外勤單位均未有實施超勤加班餘數併計。
洪申翰強調，辛苦的外勤人員也必須比照內勤實施加班餘數併計，現在中央警政署正在建置員警勤務分配表、超勤加班費(含餘數併計)等電子化功能，為的就是要簡化員警勤業務負擔、推動外勤單位差勤管理資訊化作業。警政署表示，該系統建置作業預計於今年底完成，等到建置及功能測試完成後，就能夠全面推動超勤加班費餘數併計，保障基層員警的申報加班的權益。
