北檢表示，全案由中央廣播電台主動告發，台北市刑大報請本署指派葉益發主任檢察官、程秀蘭檢察官共同指揮偵辦。承辦檢察官為保全證據，上月26日指揮市刑大持法院核發搜索票搜索吳姓、岳姓被告住居所及辦公位置。
經專案小組分析扣案物證後，承辦檢察官再於10月9日指揮市刑大、中山分局及刑事警察局科技犯罪防制中心等單位，持法院核發搜索票，第2度搜索吳姓、岳姓被告及黃姓被告之相關處所共8處，並拘提吳姓被告等3人到案說明。
檢察官於國慶日上午5時訊問後，認為被告3人均涉背信及妨害電腦使用等罪嫌，犯罪嫌疑重大，且有事實足認吳姓、黃姓被告有勾串共犯或湮滅證據之虞，加上侵害國家關鍵基礎設施的中央廣播電台的網路系統，甚至意圖於國慶日當天再次發動置換網頁攻擊行動，危害國家利益情節重大，因此向法院聲請羈押。
由於岳姓被告無羈押必要，檢方准予10萬元，並限制出境出海，實施科技監控（電子腳鐶），並命遵守不得再有網路攻擊中央廣播電台之行為。此外，台北地院裁定吳姓、黃姓被告分別具保27萬元、15萬元，檢方不服已提起抗告。
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