2014年10月台北地檢署起訴魏應充，認定他為壓低製油成本，指示味全向大統長基採購混摻銅葉綠素染色的油，以及恐引起心血管疾病的棕櫚油，分別混充包裝成21項純橄欖油、調合油販售，涉及詐欺等罪。
魏應充雖強調，味全是上市公司，考量成本是各企業及上市公司經營的重要策略，也是對股東負責的作法，且味全歷史悠久，一直是深受消費者喜愛，品質是第一考量，否認賣混油牟利，但未被法官採信，一審遭判4年。
全案上訴二審智慧財產法院後，合議庭認為確認魏應充、味全公司等皆是在不知情下誤用大統長基油品，跟其他廠商一樣為不知情被害人，判決純油部分無罪，但調合油部分，法官認為魏應充犯行明確，則依詐欺取財、虛偽標記兩罪，改判魏應充2年徒刑，全案定讞。
魏應充今天上午9點40分，在律師余明賢等人陪同下，赴台北地檢署執行科報到入監，依法魏應充至少須服刑1年並表現良好才能聲請假釋，魏應充在入獄前也特別說明，對於捐30億成立食安基金，一定會達成，已針對捐款用在技職、棒球、飲食、慈善公益等部分都有提出規畫。
