本刊獨家取得2014年1月16日，由永齡健康基金會創辦人郭台銘與時任台大校長楊泮池簽訂的捐贈暨合作規劃備忘錄顯示，永齡捐贈150億元，其中100億元籌建生醫工程館、癌醫及輻質中心等3棟建物費用，50億元作為生醫工程領域產學合作，而人事、開業準備金等經營相關費用以及醫院儀器等，由台大負責。
對於郭台銘是否持續捐款一事，台大與永齡基金會兩造存在認知落差，「永齡基金會依照當年簽定的備忘錄認定落實捐款約定，但知情人士透露，郭董曾口頭允諾要追贈醫療器材，又多次在公開場合，表態承諾會持續加碼捐款，但迄今未有進一步動作，眼看台大癌醫開幕在即，近期台大也跟永齡基金會探詢，永齡基金會卻表示目前未接獲郭台銘持續捐款指示，而郭台銘現在忙著國民黨總統初選，不敢向他詢問。」熟悉此事的內部人士向本刊透露。
郭台銘隱晦不明的捐款態度，加上允諾繼續捐款沒有白紙黑字簽約，讓台大高層進退兩難，無法編列台大癌醫的財務預算，「郭董如果要持續捐款，台大癌醫先行進行財務備案規劃，會對郭董不禮貌；但若確定郭董不再捐款，台大就要啟動備案，改由向銀行貸款、引進外部捐款或透過校務基金處理，只要台大癌醫設備到位能夠正常營運，很快就能還清借款，而不是卡在目前尷尬的狀態，動彈不得。」知情人士透露。
台大癌醫和永齡基金會的溝通，除了設備和人員問題，另有一嚴重的分歧，主要在產學合作方面。台大內部認為，永齡基金會在捐贈台大癌醫後，依規定不能也不行介入營運，只能透過產學合作聯繫。在某次會議上，永齡基金會提出要與台大癌醫共享學術研發專利成果，當時有醫生質疑永齡基金會不是單純的公益基金，旗下有生技事業，而台大是公家機構，又是國內指標學術單位，若把研發成果提供私人企業做為營利工具，恐引發社會疑慮，這部分造成雙方極大的歧見。
