張榮發2016年過世後，二房兒子張國煒公布父親的遺囑，張榮發在遺囑中指自己年事已高，為事先妥善安排後事，特立遺囑，首先是財務遺贈安排，存款以及股票與不動產，全部都由四子張國煒單獨繼承，至於公司業務接班，張榮發希望他在世時，仍由他本人決策經營方針及督導管理。
遺囑也寫到，各關係企業每年若有盈餘，希望仍須繼續捐款給他成立的張榮發基金會，支持及關注基金會的所有事務，持續行善布施，回饋社會，至於自己的後事及葬禮安排，則是不發訃聞，而以登報方式敬告諸親友，於台北市第二殯儀館舉辦告別式，一切儉樸莊嚴無須鋪張，遺體以火葬方式處理，骨灰安放在三峽白雞農場懷恩塔。
至於集團經營，張榮發要求柯麗卿次席副總裁、謝志堅次席副總裁及林榮華副總裁，要多多指導四子張國煒；百年之後的未來接班人，則指定張國煒接任集團總裁，並指定柯麗卿等人仍續任次席副總裁，協助接班及集團事務。
張榮發也要求所有副總裁要一起共同協助，讓張國煒能順利接任集團總裁，指導孫輩們的經營管理能力，公司業務要正常運作，所有員工不因他辭世而有所懈怠，所有團隊要齊心協力，更加努力地為長榮集團永續經營打拚。
遺囑中張榮發指定柯麗卿副總裁、劉孟芬、吳界源二位總裁特助及法務戴錦銓執行長四人為遺囑執行人，全權處理，遺囑最後則寫下願眾子女及孫輩們，皆能和睦相處，互相照顧。
