柯文哲的臉書也針對此事發文，他表示北市府在開防疫會議時，觀察到幾個嚴重現象，「首先，入境人士在海關填報地址時，竟然可以只填台北市，甚至半頁空白就入境。其次，許多應該要居家檢疫者，沒有去住防疫旅館，而是入住月租套房或一般旅館。」
柯文哲表示，雖然市府已多次發函中央希望訂定罰則，但迄今都沒有回應。他擔心表示，「這些不合格的居住場所，反覆接待檢疫旅客，又無法依據相關規範清潔、消毒，從垃圾清運、電梯按鈕到動線，都有可能成為防疫破口。更遑論入住這些非防疫旅館的用餐、住宿旅客，絲毫不知同棟有居家檢疫人士入住。」
柯文哲也透露，觀傳局多次和非防疫旅館業者溝通，請他們不要接待需要居檢的旅客，也多次函請中央正視「非防疫旅館讓居家檢疫者入住」造成的防疫漏洞，但中央卻不願訂立罰則，只是叫地方政府去「宣導」。讓他憂心沒有強制力，旅館業者就有恃無恐，繼續居檢、一般旅客兩邊收。
柯文哲最後表示，中央的防疫旅館補助在9月即將斷炊，旅宿業者轉型成防疫旅館的意願更低，「我呼籲中央正視，已經連續好幾個確診案例都是境外移入，源頭再不加強管制，後患無窮。」
（取自柯文哲臉書）
