針對藻礁議題，行政院院長蘇貞昌日前表示為向環保團體釋出善意，已指示經濟部評估評估中油三接工程及觀塘工業港外移的方案，但潘忠政認為，公投主文就是要求中油三接遷離大潭藻礁海岸及海域，低潮線外「5公里範圍」，政府所說的外移方案沒有遷出公投主文範圍，「哪算是善意呢？」
對此，陳吉仲指出，當時與環團的會商中，與會者認為政府有義務評估所有方案，包含外移、遷址至台北港或林口港等，不同期間有助於能源轉型方案都會討論，一切都是公開透明的，這些資料都會交給環團，最終找出減煤、增加天然氣的時程越短，同時保護大部分的藻礁，「就是我們要的方案」，而外移只是其中一個選項。
至於雙方是否會再次見面溝通？陳吉仲表示，不只要跟潘忠政一方溝通，所有團體都要，政府也有跟學術界討論這個議題，要不要再跟潘會談則需要尊重對方，當然坐下來談資訊會更透明，也會朝正面發展方向走。
不過，潘忠政認為，若上次會商提出的訴求政府沒有正面回應，也就沒有談的意義了，且再度要求與總統蔡英文直接見面會談，因為中間傳遞訊息的人都沒有實質權力，希望能直接將問題反映給蔡英文，並堅持只有公投主文上的遷離方案才是「真正友善的回應」，若評估其餘方案如外推，有點像是逼環團就範、陷環團於不義，「何必談呢？」
