潘忠政27日在廣播中透露,自己和其他環團代表22日與總統見面,當時他告知總統目前中油第三座天然氣接收站的開發仍會破壞約莫200到300公頃的藻礁生態,卻得到蔡英文「工業區開發現面積已後退1公里」的回應,讓他感嘆蔡英文仍是局外人。此外,潘忠政還稱,自己當時有約蔡英文29日去看藻礁,不過一直沒有收到總統府通知。
對此,今農委會主委陳吉仲赴立法院經濟委員會進行報告前受訪表示,當時的實況是潘忠政邀請蔡英文去看藻礁後,蔡英文回應會找時間到現場觀看,只是時間上可能無法配合,推測應該是蔡英文與潘忠政間的訊息接收有落差。
陳吉仲也指稱,蔡英文對於藻礁相當關心,現階段就是積極與環團和學術界討論如何解決問題、降低對於藻礁的傷害,經過幾個月的密集溝通,有把握找到雙贏的方案。陳吉仲更強調,能源轉型是相當重要的事情,大家如果對於「非核家園」有共識,那麼減煤、保護藻礁絕對有信心達成。