《妖果小學堂》故事源於水果奶奶因迷路,無意間闖入妖怪世界,並與妖怪們一同展開冒險旅程。負責撰寫《臺灣妖果》遊戲腳本的哇哇科技產品經理姚筠潔表示,原創故事最吸引她的部分,「就是與台灣神怪傳說的結合。」例如動畫中的「白鹿爺爺」,是以邵族的「白鹿傳說」為元素。邵族因白鹿的引導,得以發現美麗的日月潭,定居於此;因此動畫中的白鹿爺爺擁有強大靈力、知識淵博,也會保護、呵護小妖。
另外像是姚筠潔最喜歡的「艾里」,部分形象來自魯凱族傳說的「艾里里安」,會詛咒觸犯禁忌的族人,讓他們發瘋而死;但也有部分元素是源自「百步蛇王」,並以孔雀造型登場。「雖然會參考民間傳說與妖怪故事,但也會將不同意象融合後,再創造一個全新角色。」
雖然遊戲早於動畫推出,並以原作衍生的番外故事為主,但哇哇科技執行長戴丞峰強調,遊玩《臺灣妖果》仍能對原作背景、角色有更多認識;屆時動畫上映,相信也能更投入在劇情中。他還透露,動畫已在規劃第二季,而遊戲內容也被納入參考、在劇情上做出一些微調,「這是對遊戲腳本的肯定,我們對此也感到相當開心。」