國民黨陣營對於黃士修領銜提出的「重啟核四」公投案出現意見分歧，侯友宜與林姿妙2位藍營地方首長對於黨中央的立場有不同看法，先後為了核安及核廢料問題表態「反對重啟核四」。對此，馬英九昨參加「用過核燃料處理論壇」時指出，侯、林是因為不了解核廢的處理，才會反對重啟和四，並強調現在科技日新月異，面對核廢料早就從如何貯存進展到如何回收再利用，認為這2位首長的疑慮可以放下。
對於馬英九的指教，侯友宜昨下午也回應表示，他在新北市已經服務了11年，曾當過新北市核安監督委員會的主任委員，他非常了解這個問題，且核廢料長期放在新北市，對市民很不公平。今（23日）受訪時侯更再度強調，「沒有核安、沒有辦法處理核廢料，就沒有辦法去使用核電」，呼籲政府應拿出具體的辦法解決，讓民眾和產業能安心。至於是否參加國民黨主辦公投宣傳回覆，他僅回覆表示會關心市民和市政議題。
另一名被點名的首長林姿妙則指出，核四位在新北市貢寮區，距離宜蘭縣不到8公里的距離，為了45萬名縣民的健康安全，她堅持對的方向和做對的事，重申核四沒有安全就沒有商轉，與政治無關，希望大家一起努力。
