2021年4月2日上午，載滿498人的408次太魯閣號列車自樹林開往台東，行經花蓮秀林鄉和仁路段時，甫出和仁隧道就要進入清水隧道時，撞上橫躺在軌道上的工程車，造成8截車廂失控出軌，其中又以撞入隧道內的第6至8車廂釀最嚴重傷亡，生還者形容，車廂內幾乎是人疊人或人壓在椅子下的煉獄場景。此事故釀47人現場罹難、2人則是送醫後宣告無呼吸心跳，213人輕重傷分送10間醫院收治。
肇事的工程車為「義祥工業社」負責人李義祥所有，李在案發後第一時間聲稱，利用假日巡視工地，卻被抓包他前往工地是與其他工人動用怪手及工程車吊臂吊掛大型機具歸位，孰料因操作問題導致重物掉落，才讓工程車滑落邊坡。最可惡的是，李義祥在案發後沒有先打電話報警，反而先打給台鐵花蓮工務段施工主任熊德育及聯合大地公司或施工廠商東新營造求援。
全案經國家運輸安全調查委員會（簡稱運安會）與花蓮檢方聯手追查肇因，掌握的2張行車紀錄器記憶卡，還原列車出軌前5分鐘，施工邊坡未依規定架起護欄，當工程車卡在坡道旁樹叢時，李義祥竟命移工阿好操作怪手，用吊帶強拉工程車，沒想到吊帶斷裂，導致工程車翻落鐵軌，阿好只能往隧道口跑去，站在鐵軌旁的邊坡不斷揮手示警，但因太魯閣號從隧道疾馳而出，駕駛員肉眼根本來不及察覺邊坡上異樣，在反應僅數秒的情況下就直接撞上工程車。
運安會8月23日公布太魯閣號事故調查報告，並曝光完整事發時間序，台鐵早在2020年11月就明文要求各單位於連假疏運期間停止施工，李義祥一早在工廠就發現車輛電瓶電量過低，但僅接電處理就出發並未更換，李駕駛大貨車到隧道旁平台，向斜坡下方行駛卻因離合器放太快，造成車輛熄火，雖2度嘗試發動但因電瓶沒電而未成功，李試圖在車輪後擺放石頭卡住大貨車，但貨車仍數次頓挫且下滑，李操作怪手想用吊帶拉起大貨車，不料大貨車在拖動過程中吊帶脫離，陷入邊坡後翻滾墜落至台鐵軌道中央、隧道入口前。
運安會取得車頭監視器畫面，發現當司機員袁淳修看到橫躺在軌道上的工程車時，當下在4秒內就拉下手煞車鳴笛，但無奈僅100公尺左右約7秒的反應時間，即使盡最大力氣想煞停仍無法挽救。台鐵及運安會皆強調，司機員當下堅守崗位，竭盡全力剎車、鳴笛守護旅客，最後因公殉職，司機員袁淳修及助理司機員江沛峰獲內政部核定入祀忠烈祠；運安會主委楊宏智「我可以明確告訴大家，他踩了最大的煞車了，但是那4秒鐘是來不及的。」
李義祥4月2日事發當天就因涉嫌過失致死遭檢察官聲請羈押，花蓮地院3日裁定50萬元交保並限制住居及出境出海，檢方不服抗告，最後經台灣高等法院花蓮分院撤銷交保，花蓮地院重裁後改為羈押禁見，越南籍非法移工華文好（外號：阿好）8日遭羈押禁見，檢調4月10日再增加台鐵、監造商共4名被告，檢方16日偵查終結以過失致死罪起訴李義祥。
經過三次公開審理庭，花蓮地院10月22日裁定李義祥60萬元交保與共犯阿好限制出境、無保責付，兩人遭羈押近半年後獲釋。花蓮檢方不服判決提起抗告成功，28日重發地院處置，李義祥僅獲釋5天，就再度重返牢籠。其實，因過失致死罪最重可處5年有期徒刑，外界認為罰太輕了，因此法務部4月下旬時，擬具《刑法》修正草案，其中過失致死罪情節重大者，刑期分別最高可處7年與10年徒刑，但「不溯及既往」，即使草案通過，李義祥也不適用新法。
此次事故造成有49名罹難者，包含33歲列車司機員袁淳修、32歲助理司機員江沛峰、2名美國人、1名法國人、9名大學生、1名高中生、2名幼兒園學生。最小罹難者陳妍頤僅5歲與姑姑都在此事故罹難；大學生中包含就讀國體大的「短跑健將兄妹」張恩翔、張恩昀，一家四口僅母親存活。
一名救護員分享救援年紀次小的6歲罹難者楊琪蓁一家三口的心碎過程，楊父頻求救2個女兒，看到滿身是血但有意識的大女兒才鬆一口氣，卻見小女兒被抱往OHCA傷患區時，脫口「可以再讓我抱抱她嗎？」，讓在場的人都紅了眼眶。
此外，新婚才1年的袁淳修，2016年考進台鐵局服務，2017年擔任助理司機員後，平日多數被派遣駕駛東部幹線列車，2018年獨立上線駕駛車輛，當年「普悠瑪號」在宜蘭發生脫軌事件時，袁剛好休假逃過一劫，袁家以為大難不死必有後福，孰料此次因清明連續假期，被調度值班，才坐上死亡列車的駕駛座。
時任交通部長林佳龍在處理後完太魯閣號事件一段落後引咎請辭；針對這起嚴峻事故，由於捐款的人眾多，衛福部設立捐款專戶提供受害者及其家屬，衛福部長陳時中強調該款項用皆會用在罹難者及傷者、家屬、目睹乘客與救災人員，用途包含生活扶助、醫療補助、教育資助、心理重建、法律扶助、災民及其家庭服務方案。
