獨立記者缺少媒體集團做後盾,要隻身承擔法律責任,查證過程得更謹慎。李惠仁舉出:「拍《不能戳的秘密II:國家機器》時我收到很多資料,怕造假不敢使用,要不斷交叉比對,用客觀方式驗證、找證據,過程發現假設錯誤也要調整。」
紀錄片《不能戳的秘密》系列發展至今,最困難的是尋找願意公開談論議題的專家,國內多數學者因顧慮申請研究經費受阻婉拒受訪。為此,李惠仁遠赴法國世界動物衛生組織(WOAH)總部查證禽流感高、低病原性的定義,又飛往美國紐澤西羅格斯大學(Rutgers University)了解實驗室如何管理病毒與微生物,增加大筆費用,使《不能戳的秘密III:官官相護》總製作費超過600萬元。這兩年李惠仁靠接拍商業短片來填補,還首度申請文化部「紀錄片製作補助」獲300萬元,加上支持他理念的親友贊助,補足所需經費。
李惠仁認為紀錄片只能發現問題,解決問題該由握有公權力和資源的政府負責。他也以平常心看待作品後續發展,「影片能發揮多少影響力,要看運氣和時機。」即使無法改變現狀仍堅持不懈,因為唯有持續和更多人參與,公民社會的力量才會越強大。