卓榮泰上午赴立法院進行施政報告並備質詢，進入立法院前接受媒體聯訪時表示，感謝立法院長韓國瑜，他們私底下都有一些溫暖的互動，希望可以化為在議場及政策討論上的實際行動。他希望兩院正常、平穩的互動與運作，國會可以是人民的希望，不要成為朝野的戰場。
然而今上午立法院新會期才剛開議，場內的朝野立委就展開角力，民眾黨團針對行政院長卓榮泰及NCC代理主委翁柏宗的行為提出強烈抗議，批院長違法濫權、舉牌要求翁柏宗辭職。
在處理報告事項時，加入國民黨團運作的無黨籍立委高金素梅，針對行政院函請審議「114年度中央政府總預算案」及「中央政府前瞻基礎建設計畫第5期特別預算案」案，提出異議，要求退回
在國民黨團與民眾黨團聯手的情況下，表決以59票同意勝過民進黨團的46票反對，總預算案被退回程序委員會。
國民黨團事後發出新聞稿，指總預算案中未見農業部、原民會編列足夠相關預算，並批卓內閣補貼台電1千億，以及「大內宣」預算暴增，讓全民無法接受，因此提案退回，要求行政院重編預算，再送立法院審查。
卓榮泰在施政報告時稱，政府有責任和義務，持續推動國家前進，會持續推動8大施政目標，包含「擴大社會投資，減輕家庭負擔」「創新經濟，智慧國家」「綠色成長與2050淨零轉型」「擴大醫療投資，打造健康台灣」「均衡台灣，在地希望」「厚植軟實力，打造國家品牌」「邁向多元平權的共榮社會」「打造韌性台灣，維護安全與和平」，盼朝野能不分黨派、理性監督、團結合作。
對於總預算案被退回他表示深感遺憾，認為只要適度的說明，立法院應該可以理解。行政院發言人李慧芝也透過媒體群組表示遺憾，但強調政府機關一定會秉持「誠意溝通」的精神，在祥和、穩定以及負責任的態度下，針對中央政府總預算案以及前瞻基礎建設計畫預算案與立法院持續互動與對話。
