九合一大選綁10項公投案，包括幸福盟提的「婚姻限一男一女」、「國中小不應教同志教育」、「立專法保障同志權益」，國民黨提的「反空汙」、「反深澳電廠」、「反核食進口」，以及擁核人士所提「以核養綠」等7案均高票過關，創下台灣首度有公投案過關的歷史紀錄，成為行政部門未來施政的依據。
同運不氣餒 未來會更好
至於同運團體提出的「修民法保障同志建立婚姻關係」、「國中小實施性平教育」及前國手紀政等人發起的「東京奧運正名」等3案則未過關。其中，婚姻平權兩案，不同意票多於同意票300多萬張，顯示推動同婚仍有一段路要走；東奧正名案不同意票多於同意逾百萬票，極可能與選手擔心無法在國際賽會參賽有關。上述3案依法2年後才能再提，勢必趕不上2020年總統大選，但仍可在2年後捲土重來。
對此，同運團體「婚姻平權大平台」總召呂欣潔認為，保守勢力總有一天會被這世界淘汰，她認為「反同勢力越想把同志往黑暗裡推、讓我們站在主流社會外，我們越會站在陽光下告訴你，就像所有通過婚姻平權的國家一樣，這是早晚的問題。」
台灣同運先驅祁家威則認為，雖然這次公投沒過，但其實已經不錯，因為與30年前台灣同志處境相比，未來一定會更好，支持平權者只會以倍數增加，反方人數則會越來越少。
即個3月內 提同婚專法
伴侶盟也回應表示：「這是一場極不公平的公投戰，我們面對的是富可敵國的巨獸，用上億資金對台灣社會進行洗腦式宣傳，煽動偏見，散布對同志的仇恨與恐懼。反同愛家公投雖然通過了，但我們要提醒行政院堅守憲政秩序，務必依據大法官釋憲意旨，平等保護同志公民的結婚自由。」
對於公投案過關，幸福盟呼籲，政府未來在修訂相關法律及制訂國中小課程時，需依照此次公投結果執行，他們將成立修法小組，用最快的速度將草案送進立法院，持續推動家庭主流化。幸福盟也說，他們絕對不是反同，而是希望共同建立和諧社會。
大法官會議去年5月做成解釋，認為《民法》有違憲法保障人民婚姻自由、人民平等權，要求法務部在2年內修法，保障同婚權利，但對於該修《民法》還是另訂專法，挺同及反同兩派意見不一，讓法務部傷透腦筋。
行政院發言人Kolas表示，幸福盟提出的公投案過關，行政機關將在3個月內提出保障同性婚姻的專法草案送交立法院，立法院則需在下個會期休會前完成審議程序，但立法院是否會通過專法或立委自提版本修民法，屬於立委職權，行政院會予以尊重。司法院則表示，立法機關必須尊重公投結果，並採納為立法、修法方向，但無論公投結果如何，仍然不能違背大法官會議對保障同性婚姻的解釋文。對於性平教育公投過關，Kolas也說，將請教育部重新審視相關內容。
核電廠延役 官方難照辦
以核養綠的提案人黃士修表示，將要求政府討論3座核電廠延役及重啟核四廠，如果政府不給人民一個滿意的答案，他還會再發動以核養綠公投2部曲，以重啟核四綁定2020總統大選，並推動由雅美達悟族人領銜，將核廢料遷出蘭嶼的公投。
對此，Kolas表示，公投結果雖顯示多數民眾希望廢除電業法第95條第一項「核能發電設備應於中華民國114年以前，全部停止運轉」，不過，政府推動2025非核家園的目標不變，因核電廠在除役期限前5到10年，必須提出延役申請，實務上已不可能讓核一、核二與核三廠延役。
至於重啟核四廠案，Kolas說，台電今年評估，核四商轉尚需6到7年，且要耗資新台幣688億元，如果明年重啟核四，6年後即2025年，非核家園目標已達成，屆時已不需核電，核四已無商轉必要。
其他包括反空汙、反核食及反深澳電廠等公投案皆過關，Kolas表示，改善空汙與維持穩定電力是行政院的原則，將請經濟部在確保供電無虞下，努力達成每年降低1％火力發電的目標；停建燃煤電廠部分，行政院長賴清德已宣布停建深澳電廠，公投結果與政府的施政方向一致；反核食案行政院會請衛福部依公投法規定，在食品安全前提下，繼續對日本食品進行查驗，讓民眾吃得安全、安心。
東奧不正名 政院稱尊重
東奧正名未過關，身兼聯盟召集人的前體委會主委楊忠和，及提案發起人之一的醫師陳永興表示，對結果並不氣餒，未來將持續為提升台灣國際地位發聲，日前已赴台北地檢署控告中華奧會主席林鴻道散布假消息，威脅選手、教練連署反對東奧正名公投，涉犯偽造文書、強制等罪；Kolas則說，尊重公投結果。
《公民投票法》過去因門檻過高，被稱作「鳥籠公投」，昔日僅有6個全國性公投案，且都與總統大選合併辦理，包括2004年的強化國防公投、對等談判公投、2004年的討黨產公投、入聯公投、務實返回聯合國公投、反貪腐公投，但從無一案過關。
去年「公民投票法修正案」通過，大幅降低提案、連署及通過門檻，下修公投投票年齡至18歲，且改為有效同意票數多於不同意票，及有效同意票達投票權人總額1/4以上者，即為通過，門檻大降，公投提案瞬間暴增到37個，最後成案的有10案，並在此次投票一舉通過7案。
公投15億 效用待關注
根據《公民投票法》規定，若開票結果，同意票數超過門檻、且同意票比不同意票多，就算通過。反之就是不通過，2年內不得再提出同樣的公投案。公投案通過，若屬於法律者，該法律條文在中選會公告公投結果第3日起則失效；若是重大政策，主管機關必須對公民投票案內容實現具體處置，究竟政府花了15億元進行公投，是否作為政府施政首要方針或淪為大型民調，各界拭目以待。
雖然公投可直接展現民意，但多案一起投導致過程龜速，亂象橫生，很多選民須排隊一個多小時才能投完票，加上中選會宣布下午4點投票截止前排隊的民眾都可投票，不少選民邊看開票邊投票，恐影響選舉結果，投開票作業更是到翌日凌晨3點48分才完成，創下台灣選舉史上最離譜的紀錄。
角逐台北市長的國民黨候選人丁守中首當其衝，以3千200多票的些微差距落選，質疑中選會藉此操作棄保，氣得連夜向台北地院提出選舉無效之訴，中選會主委陳英鈐已成頭號戰犯，已請辭獲准。
