特偵組指控，辜家父子等人涉嫌分別主導挪用、掏空中信金3億美元(約百億台幣)，從2004年到2007年間，以中信金控旗下中信資產公司投資不良債權名義，利用陳俊哲、張友琛、吳豐富、張素珠、李聲凱、歐詠茵、黃汝強等人擔任信中信資產公司、CTO公司及相關境內外的公司負責人、承辦人機會，將中信資產透過中信商銀香港分行及台灣總行，轉匯到辜仲諒和父親等人投資的境外公司，或陳俊哲等人名下帳戶10餘次，侵吞中信金控資產3億美元。
檢察官另指控，辜仲諒另涉與國寶集團總裁朱國榮共謀利用中信金併購台壽保，導致中信金集團虧損，2016年10月間，依違反《金控法》《銀行法》等罪，將辜仲諒等人起訴，辜仲諒出庭時強調，自己沒有犯罪，起訴書寫的不是事實，檢察官指的帳戶也不是他在管的。
辜仲諒遭起訴後，曾透過律師團發布聲明強調，創辦人辜濓松生前處事向來公私分明，絕不可能有挪用公司資產情事；特偵組在當事人無從答辯的狀況下，逕指為侵占中信金控公司資產的共犯，實令人感到錯愕！他還說，對於特偵組檢察官偵辦本案的6年期間，無法以客觀、公正立場偵辦。
此外，檢方起訴辜仲諒等人，主要證據之一，是辜的前妹婿陳俊哲2015年4月在海外的越洋視訊作證，但法院開庭時，辜仲諒的律師發現，視訊內容，陳俊哲均表示拒答，辜的律師團也指出而外界認為CTO公司侵占3億美元（近百億台幣），但實際上CTO公司沒有賠，反倒賺4,000多萬美元（近新台幣1.3億元），這樣哪有造成損害，法官認定辜仲諒的確沒涉及不法，今判無罪。
