法醫所表示，武漢肺炎疫情之初，法醫所早在2月3日函頒《法醫相驗及解剖通報流程》，詳列疾管署各區管制中心聯繫窗口，請各地檢署於執行相驗案件遇有疑似肺炎時應立即聯繫通報。
為避免遇有不明原因死亡屍體，無法立即判斷是否符合疾管署發布肺炎病例定義時，基於「料敵從寬、禦敵從嚴」原則，法務部長蔡清祥也立即指示應先採檢送驗，避免相關人員受到感染成為防疫破口，法醫所也在上月3日再度發布《疑似武漢肺炎案件法醫相驗通報處理流程及說明》，由各地檢署法醫採檢後，法醫所協助通報疾管署並立即送驗。
法醫所說，解剖時均以最高防護標準，包括穿戴全身式防護衣、防護面罩及正壓呼吸器，解剖室全部消毒以避免血液、體液污染，解剖後依傳染病防治法相關規範執行環境消毒，屍體以兩層屍袋逐層包覆消毒並標記生物危險提醒字樣與解剖者聯絡方式，解剖後廢棄物用兩層專用垃圾袋包裝並消毒，同時也會再採檢送驗確認為陰性，以利法醫解剖後自主健康管理。
此外，法醫所還提供各地檢署檢察官、書記官、法醫及鑑識人員防疫裝備，由於各地檢署防疫物資儲備量不一，法醫所已檢送較缺乏的連身防護衣及採檢相關物品（病毒拭子、送驗單、採檢說明）給各地檢署使用，再由法醫所統籌向疾管署申請其他防疫裝備，在疾管署支持下，本月1日也順利迅速轉發包括N95口罩、防水隔離衣、連身防護衣、護目鏡、拋棄式面罩等防疫物資給各地檢署。
法醫所表示，這波肺炎嚴峻疫情，已與全國各地檢署與疾管署及各區管制中心、衛生局建立橫向聯繫網絡，密切掌握死者旅遊史、居住史、接觸史及就紀錄等是否符合武漢肺炎通報定義，至4月17日止，各地檢署除透過當地衛生機關送驗外，法醫所協助地檢署送驗12件，解剖送驗6件，合計送驗18件，計陰性17件，1件尚檢驗中。透過機關通力合作及安全防護，共同守護國人健康。
