製作人高瑞陽自信表示，儘管早前《茶金》已為拍攝取景跑遍全台，《商魂》完全沒重複使用的場景。其中，詢問度最高的林燈家景，位在新竹縣新豐鄉一處徐家私宅，內部由美術指導鄭予舜利用隔板及鏡位遮蔽天花板穿幫部位，加上歐、台、日式家具混搭，為對應林燈日本留學生背景，使用日式雲紋圖騰壁紙打造符合主人公氣質的書房。
首集水泥經銷商福華樓宴客場景，真實場地是位在桃園市石門水庫旁的石園活魚餐廳，劇組除了調度千名臨演塑造人潮盛況，還將原本空曠的二樓，利用大片雕花屏風隔成較具隱密性的包廂空間。
李國毅劇中經常出入的豔花樓，位在雲林縣虎尾鎮的縣定古蹟涌翠閣，是全台保存最完整的日式建築；田中千繪經營的雅美洋服店，則遠赴苗栗一處結合老片場的露營地搭景，外觀重新拉皮，復刻早年紅磚拱廊結合巴洛克式的建築門面，再利用電腦動畫合成有汽車行駛的熱鬧街景。
而第二集中，傅孟柏和李國毅吃雞蛋拌飯的戲，桌上一瓶辣椒醬也意外成焦點。原來網友以為是台中著名的東泉辣椒醬，截圖放大才發現瓶身寫有「協」字圓標，其實是美術團隊在台灣歷史博物館網站資料庫收集到，當年由草屯鎮協興醬酒廠出產的產品。
