柯建銘指控,馬英九在2013年8月31日半夜,聽取當時檢察總長黃世銘報告偵查機密後,除將機密外洩給當時行政院長江宜樺、總統府副祕書長羅智強,隨即再打電話請黃世銘於隔日來補充報告,並對外說柯建銘關說司,涉嫌教唆洩密及誹謗等罪,北院一審在3月間,認為事證不足,判馬英九無罪,柯建銘上訴二審,今進行最後的辯論。
馬英九另案遭台北地檢署起訴洩密罪,台北地院8月24日判他無罪,馬英九今針對遭自訴上訴案到高院出庭時,媒體問他關於另案判無罪的看法時,他微笑說:「謝謝大家!」;柯建銘在進入法庭前則說,對於這場訴訟,有信心能逆轉勝。
庭訊時,柯建銘強調,馬英九教唆前檢察總長黃世銘洩漏偵查機密,又不實指控他涉及司法關說,柯建銘說,馬英九犯行明確,卻一直狡辯,毫無悔意,他認為,馬英九破壞憲政審制,導致憲政崩盤、司法崩盤,柯建銘還說,馬英九一審獲判無罪,台灣的司法已進入加護病房,已到了懸崖邊,憲法也被穿上葉克膜急救;馬英九的律師團則說,柯建銘涉入關說司法,已由檢評會、一審判決及黃世銘有罪案判決3度認證,馬英九並未涉誹謗。
馬英九隨後強調,自己是處理司法關說案,捍衛司法純淨空間,之前曾有高雄市議員因關說5張違規罰單而遭判刑失去議員職位,不久前立法院蔡其昌副院長辦公室也因為正式發文「關心」假釋申請而遭社會非議,馬英九說,這顯示關說司法受到社會普遍的譴責與否定,但製造關說醜聞的柯建銘立委,至今仍在法庭大言不慚說要捍衛憲政體制、終結特務治國,馬英九說,這真是理不直而氣壯,義不正而辭嚴。
對於柯建銘說憲政在懸崖上,馬英九認同說,目前憲法真的遭遇危機、在懸崖上了,他呼籲身為國會執政黨的大黨鞭的柯建銘,為了免於憲政摔下懸崖,應盡快痛改前非,提出《刑法》修正案,將「妨害司法公正罪」完成立法,以名留青史、光耀史冊;全案今辯結,訂10月11日宣判。