《疫起》監製李耀華表示，片中選角早在修改劇本階段就有零星的討論，有時大家劇本聊一聊就會問「你覺得要這個角色可以找誰？」不過重點還是先專注在劇本。導演林君陽透露，薛仕凌、王柏傑是最早確定的。王柏傑因為曾多次演出李耀華監製的作品，有合作默契，所以片中男主角胸腔外科醫師夏正一角，就直接想到他。後來實際見面往下聊也覺得王柏傑很適合，沒討論任何備選人選，就選定王柏傑。
王柏傑在片中飾演原要回家為孩子慶生的爸爸，卻臨時被召回，被迫留在因院內感染突然封院的醫院。為了演出開刀戲，王柏傑除了得練習手術縫合技術，還跟外科醫師一起模擬手術流程。正式開拍時，他全程穿著特殊覆膜防護衣（兔寶寶裝）以呈現疫情下防護開刀護理人員遭病毒感染的情境。該場戲拍攝3天，王柏傑每天全副武裝拍攝超過12小時，經常汗如雨下，他也更能體會醫護人員的辛苦。
薛仕凌飾演的週刊記者在封院之前即假扮病人潛入院內調查，為了解記者工作與心態，劇組特別找一位約在2003年入行的記者跟他講當年的媒體環境以及可能的行為、思考方向等。
至於由樓一安、王明台等導演客串演出病人，林君陽笑說：「不是我找的，是他們本來就喜歡演戲。」其中王明台是透過選角指導，發現他與戲中飾演兒子的陳家逵有點像，於是請他演出因病厭世的病患。
