吳清源除專注機車本業外，經營觸角也相當多元，運用不動產開發經驗，積極活化三陽土地資產，他說，「有這個能力發展另一個產業，那也是風險的分攤 ，如果幫公司挹注利益有什麼不好。」像是他將內湖舊廠區1.12萬坪土地，與美孚建設合作開發興建5棟商辦大樓，三陽分得其中2棟，吸引星宇航空等大型企業進駐。
去年10月，三陽透過子公司上揚資產管理公司入主農林，拿下8.01%股權成為第一大股東，引發外界關注，吳清源精打細算的分析，「主要是長期投資規劃，不是要搶經營權，是針對碳權問題及早做準備，不然未來政府宣布要碳權，那時候搶地價格就高了。」在新北市、桃園、苗栗、南投都有土地的農林，是台灣僅次台糖的第二大地主，主要種植茶葉，也有休閒茶廠、農場等事業。
