陳佩琪的父親是國小老師，母親結婚前在行政機關做過文書，19歲結婚後就離職，成為家庭主婦。「這在那時候是很common（尋常的、普遍的）的事，很多人都覺得男主外、女主內，就是『相夫教子』嘛，我對相夫教子這句話是很感冒的。但說實在，相夫教子是一種傳統觀念，雖然台灣在法律規定上男女平等，但真的能夠做到的夫妻或家庭真的是不多。像我本身的次專科是走新生兒學，我常遇到新生兒出生不被父母親喜歡，看了都快哭了，為什麼？因為生到查某耶！雖然法律已規定孩子姓氏可由父母雙方約定，但我做醫師這麼久，有誰約定到母親姓氏？寥寥無幾啦，除非雙胞胎。」
【陳佩琪番外篇二】自詡折衷式女性主義 推廣男女平權
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問陳佩琪為何選小兒科？她說：「我們那年代首選就4大科（內、外、婦、兒）啦，成績比較沒法走4大科的，或女生要走4大科要先在外面流浪2年，台大醫院才會接受，那時的性別階級就是這樣子。所以我當市長夫人之後，一直很想推廣性別平等，不過很不容易啊，台灣法律對女性是平等的，但實務上對女性還是很多不公平的地方。」
她在家中4個孩子裡排行老么，父母對每個孩子的教養十分開明，從來不會重男輕女。「我的父母親教養我，也沒說女生就少吃一碗飯或怎樣，對我跟哥哥的教養都一樣。但為何嫁出去的時候，我就變成不是你們家的人了？為什麼我就不能陪你們了呢？」
又說：「我真正開始感受到男女生有不一樣的待遇，想也知道，是結婚以後才會知道。tradition（傳統）就是這樣啊，你沒有辦法去對抗傳統。我常覺得我如果是這麼摩登的女性，雖然我嘴巴可以講到一些男女平等的話，但我卻是一個腦袋瓜很遵從傳統的人。不是說我公婆特別保守，上一代就是這個樣子啊，媳婦嫁來就是我們家的人了。」
所以思想上妳很女性主義，落在現實，卻有不得不屈服的地方？「對，但我會compromise（折衷），覺得說我願意妥協，有些理論需要慢慢漸進，不是一蹴可幾，但這觀念需要有人宣導，或許到了下一代，價值觀就比較容易改變了。」
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