刺蔣案後，據說蔣經國不只一次問身邊人：「為什麼台灣人要殺我？」有學者稱這是蔣經國自省、重用台灣人的起因。黃文雄怎麼看？他說，蔣經國確實算聰明，但也不夠聰明，歷史上多少殖民者早就知道收買本土菁英來鞏固少數統治。至於有些人稱蔣經國此舉是台灣民主化的開始，他說，許多人早已反駁過，果真如此為何後來還有美麗島大審、林宅血案、陳文成命案等。
【刺客餘生之四】不當英雄不從政 他是清簡過活的彼得潘
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返台後他成了台獨支持者的英雄，他卻始終無意從政，例如民進黨幾次想提名他當不分區立委，他都婉拒，只在2000年陳水扁擔任總統後允諾當國策顧問，但後來行政院長謝長廷推動「全民按指紋」，引發侵害人民隱私的疑慮，黃文雄與人權團體聲請大法官釋憲，最後全民按指紋確定違憲。打贏釋憲案，黃文雄辭職回到社運圈，從此沒再擔任過政治職務，始終一個人過著清簡的生活。
不過他說該肯定蔣經國一點，蔣去世前1、2年終於體認民主化是不可擋的趨勢，「沒有像其他獨裁者一樣玉石俱焚的鎮壓到底。」但他也強調，人們以此肯定蔣經國時，別忘了「幫忙救火的人也是原來放火的人。」
中研院台灣史研究所副研究員吳叡人這樣看刺蔣：「斬首行動對獨裁政權而言是合理的，群龍無首就亂了，就有空間。」他又說，當年北美的台獨人士多是留學生，「很多人在1970年代已經成為專業人士，在大學得到穩定職位，在社會階級屬性上不太可能做這些事，不是亡命之徒，所以對手還半開玩笑稱他們是週末革命家。」因此大家雖喊著革命、暗殺蔣經國，真正行動的僅黃、鄭那次。
投入社運 思想新潮
吳叡人也是黃文雄的多年好友，他描述黃文雄：「他外號Peter，英文裡的Peter Pan，永遠長不大的男孩。」他說，有些人20歲時想法很激烈，30歲卻變成體制派，黃文雄卻從未改變，「他回台後不接受英雄光圈，馬上投入社會運動，以人權做切入點，引進很多新觀念，像最近談的全民基本收入。他永遠把自己當成現役的運動者，我整整晚他一個世代，可是我在美國讀到的書他都知道，他沒有停止follow社會科學的各種最新思潮。」
彼得潘的心靈永遠十幾歲，身體卻大不如前了。黃文雄而今說話緩慢，偶爾還會停頓一會兒，他說，2002年首次小中風後，檢查出血管型失智症，雖不像妹妹黃晴美屬阿茲海默，但十多年來認知能力不斷下降。
菸是難戒了，但他努力運動，例如我們約在捷運站時，他利用空檔在站內來回走路，採訪結束回捷運站，列車來了他卻不搭，說還得繼續走路。永遠的現役運動者，他不眷戀歷史只奮力前行，雖然如今一天走得比一天更吃力了。
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