綜合日媒報導指出，8月19日凌晨監視器拍到，犯案的中國籍少年爬上靖國神社石柱的台座，在石柱寫下「軍國主義去死」、「廁所」、「狗」等字句，接著離去，警方透過進一步調查，掌握到該名少年身分。
犯案少年還在中國聊天群組中，分享和靖國神社拍照的自拍照，以及塗鴉後的石柱照片，並表示，「靖國神社是垃圾」、「完成了我的人生夢想」等文字，引發關注。根據調查，少年和一名疑為親屬的女子在犯案前幾日入境日本，犯案後獨自回到位於新宿的臨時住所。
該名少年隨後在8月19日上午搭乘飛機，從羽田機場前往香港。警方認為，少年雖然和另一名女性一起到日本，但整起事件應為少年一人所為，因此只申請該少年的逮捕令。靖國神社不只一次遭到中國人破壞，5月31日一名中國網紅在靖國神社石柱上，以噴漆噴上「Toilet（廁所）」一詞，還對石柱撒尿，警方也對涉事的3人發出逮捕及通緝令，其中留在日本的1人已被逮捕。
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